هناك عدد لخرائط الجينوم المادية..
أنواع الخرائط:
الخرائط منخفضة الدقة للجينوم:
- خريطة الكروموسوم: يتم تخصيص الجينات أو قطع الحمض النووي الأخرى التي يمكن التعرف عليها لصبغياتها المناسبة في خريطة الكروموسومات، ويتم تحديد المسافة بينهما في أزواج قاعدية. يمكن استخدام التهجين في الموقع، وهو عملية تتضمن تعليم علامة الحمض النووي بعلامة مرئية، لربط هذه العلامات فعليًا بنطاقات محددة. بعد أن يتصل المسبار الموسوم بحامل الحمض النووي التكميلي في كروموسوم سليم، يمكن تحديد موضع المجس.
باستخدام الكروموسومات أثناء مرحلة الانقسام الخلوي، تم تحقيق دقة خريطة تبلغ 100000 نقطة أساس. - خريطة cDNA: تم توضيح مواقع مقاطع DNA التي يتم ترجمتها إلى mRNA فيما يتعلق بمناطق أو نطاقات صبغية معينة في هذا المخطط. تُعرف بعلامات التسلسل المعبر عنها ، هذه الأجزاء الصغيرة (cDNA).
يمكن استخدام ESTs المتعددة لتمثيل الجين. والتي قد تشير إلى العديد من النصوص المقسمة بدلاً من ذلك أو أقسام مميزة من النص.
وبالتالي، تم اختيار مقاطع بها ثلاث مناطق غير مترجمة (3 ‘UTR) أو mRNAs لأغراض رسم الخرائط ، ويمكن تحويل هذه التسلسلات بكفاءة إلى مواقع ذات علامات تسلسل محدد للجينات (STS).
يمكن لخريطة (cDNA) أن تقدم الموقع الكروموسومي للجينات التي تكون وظائفها غير معروفة حاليًا ، وغالبًا ما تكتسبها الأسماك. ونتيجة لذلك ، فإن هذه الخرائط لها أهمية بيولوجية وطبية أكثر.
الخرائط عالية الدقة للجينوم:
من أعلى إلى أسفل (إنتاج خريطة استخراج دقيق) ومن أسفل إلى أعلى (إنتاج خريطة مادية عالية الدقة) هما الطريقتان الحاليتان لرسم الخرائط المادية عالية الدقة (مما يؤدي إلى خريطة Contigs).
يتم هضم كروموسوم واحد مع (إنزيم تقييد نادر) إلى قطع كبيرة ، ثم يتم تنظيمها وهضمها بشكل أكبر إلى أجزاء أصغر ، مما يؤدي إلى خريطة تقييد دقيقة تصور ترتيب مواقع انشقاق إنزيم القاطع النادر والمسافة بينها. دقته ضئيلة ، مما يجعلها غير مناسبة لاكتشاف جينات معينة. علاوة على ذلك ، نادرًا ما ينتج عن هذه الطريقة امتدادات للمواقع المعينة.
في الجزء السفلي من الطريقة ، يتم هضم الكروموسومات إلى قطع أصغر ، يتم استنساخ كل منها وترتيبها في مكتبة مصفوفة. Contigs عبارة عن قطع DNA متجاورة تم ترتيبها إلى شرائح. استنساخ شظايا الحمض النووي الضخمة باستخدام ناقلات الكروموسومات المصنعة صناعياً والتي تحتوي على أجزاء من الحمض النووي البشري يصل حجمها إلى 1 ميغا بايت ، مثل الكروموسومات الاصطناعية في خلايا الخميرة (YACs). قبل تطوير YAC ، كان يمكن لأكبر نواقل الاستنساخ (الكوسميدات) أن تحمل أجزاء داخلية من 20 إلى 40 كيلو بايت فقط.
يمكن أن يوفر الاستنس
